但这款曾“风靡一时”的软件，安全问题始终备受争议。从技术层面看，P2P技术虽提升了传输效率，却也埋下隐患：在共享文件时，可能意中下载到携带病毒、木马的恶意文件，这些文件可能窃取隐私、设备，甚至导致系统崩溃。早期快播软件本身也被曝存在安全漏洞，例如2013年曾被检测出“远程代码执行漏洞”，黑客可利用漏洞在设备上执行任意代码。
内容层面的风险更为突出。快播的“资源丰富”，很大程度上依赖自主上传和分享，这使得平台上充斥着大量未经授权的盗版影视、音乐内容，甚至包含淫秽色情等违法信息。在观看这些内容时，不仅可能因侵犯知识产权面临法律风险，接触不良信息也会对个人尤其是青少年造成负面影响。
官方运营的合规性问题更是将快播推向风口。2014年快播公司因“传播淫秽物品牟利罪”被调查，案件审理中披露，快播通过技术手段为访问淫秽内容提供便利，相关行为已违反法律法规。尽管快播声称“技术中立”，但平台监管缺失，使其成为违法信息传播的工具。
此外，数据安全也难以保障。快播在运行过程中会收集的观看记录、设备信息等数据，而可能存在观看记录、设备信息等隐私数据泄露的风险，这些数据若被不法分子获取，可能用于精准诈骗或其他违法活动。
随着监管加强，快播已于2016年停止服务，官方渠道的软件和资源均已下线。但需警惕的是，目前网络上仍有打着“快播”旗号的非官方软件，这些程序多为恶意软件，可能捆绑病毒、窃取信息，安全风险远高于原版快播。