《翼年代记》漫画已结。其最终章《翼·次元记》于2016年6月连载，单行本全28卷收录了从启程到结局的整故事线。
结局中，小狼为了找回被飞王篡改的时间线，选择以“永恒的旅行”为代价，与小樱共同踏上没有终点的次元之旅。黑钢放弃成为日本国君主，回到玖楼国守护知世公主；法伊在失去魔力后，与黑钢结伴同行，两人在不同次元中继续冒险。摩可拿则成次元引导者的使命，回归侑子与库洛的身边。
小樱在集齐所有羽毛后，发现真正的愿望是与小狼共同面对未来。两人在次元裂缝中许下约定，即使记忆不断重置，仍会在旅途中寻找彼此。最终画面停留在两人背靠背走向未知次元的背影，手中紧握的羽毛化作连接时空的纽带。
故事以开放式结局收尾，“旅行本身即是意义”的主题。所有角色在经历数世界的悲欢离合后，都找到了属于自己的归宿，而小狼与小樱的旅程则成为跨越次元的永恒传说。