双大蛇Z的剧情模式包含“魏”“蜀”“吴”“战国”四条初始剧情线及“大蛇”剧情线，要实现全剧情锁，需分阶段满足特定条件。
游戏初始可选择“魏”“蜀”“吴”“战国”任意一条路线开始。每条路线的关卡锁遵循线性推进原则：成当前关卡后，系统自动锁后续关卡。部分高难度关卡需达成前置关卡的“战功目标”，例如在指定时间内击破敌方总大将、保护特定NPC存活等，满足条件即可锁隐藏关卡。四条初始剧情线各自独立，需分别成全部关卡，包括最终章的决战关卡，才能触发“大蛇”剧情线的锁。
“大蛇”剧情线作为核心主线，锁条件为“魏”“蜀”“吴”“战国”四条剧情线全部通关。成这四条路线的最终关卡后，系统会提示“大蛇篇”开启，新增涵盖三国与战国联合对抗蛇魔远吕智的整剧情。大蛇篇的关卡同样需要逐步推进，部分关键战役如“火河之战”“古志城决战”需达成特定战功，例如敌方武将全灭、我方军团败走记录等，才能锁后续章节。
此外，部分外传关卡的锁依赖角色联动条件。例如，使用特定组合的三国与战国武将通关某一关卡，或在战斗中满足隐藏道具收集条件，可锁“凉州之战”“白帝城之战”等特殊剧情关卡。这些外传关卡虽不影响主线流程，但会补充世界观细节，且部分隐藏武将需通过外传关卡锁。
整体而言，剧情模式全开需成两大步骤：一是分别通关“魏”“蜀”“吴”“战国”四条初始路线的所有关卡，包括达成战功目标锁的隐藏关；二是在此基础上开启“大蛇”剧情线，逐步成其章节关卡。所有路线的进度相互独立，需玩家逐一推进，通过战役胜利与战功达成，最终锁全部剧情脉络。