我国是水生生物资源丰富的国家，长江流域凭借独特的自然条件，成为我国水生生物种群规模最大的流域。
长江全长6300多公里，流域面积180多万平方公里，覆盖19个省、自治区、直辖市，水系发达，支流纵横，仅流域内年径流量就占全国河川总径流量的36%，为水生生物提供了广阔的生存空间与充足的水资源补给。从上游的金沙江峡谷到下游的长江三角洲河口，从汉江、湘江等支流到鄱阳湖、洞庭湖等通江湖泊，多样的生境形成了复杂的水生态系统，支撑着庞大的水生生物种群。
长江流域的水生生物种类与数量在国内首屈一指。仅淡水鱼类就有400多种，占全国淡水鱼类总数的70%以上，其中特有种超过100种，如中华鲟、胭脂鱼、长江刀鱼等，均依赖长江水域成生长、洄游等生命周期。除鱼类外，江豚、水禽、水生植物以及底栖生物等共同构成了长江的生物群落——江豚在干流与通江湖泊中游弋，苦草、菹草等水生植物覆盖湖底，螺类、贝类等底栖生物为众多鱼类提供食物，形成了整的食物链，维持着种群的稳定与繁荣。
对比国内其他流域，黄河流域因降水较少、含沙量高，水生生物种类与数量远不及长江；珠江流域虽水量丰富，但流域面积与生境多样性稍逊。长江以其广袤的水域、丰富的水量和复杂的生态结构，支撑了我国规模最大的水生生物种群，成为水生生物资源的核心宝库。