天然水晶的价格受品种、晶体品质、大小、工艺及产地等因素影响，差异显著。从入门级到收藏级，价格跨度可达几十元至数万元，以下按常见品种梳理其价格范围。
白水晶作为最常见的天然水晶，价格相对亲民。普通白水晶手链、吊坠，晶体通透度一般、明显棉絮或冰裂的，价格多在50-300元；若晶体纯净、杂质，且尺寸较大如直径12mm以上的圆珠手链，价格可升至300-800元；收藏级白水晶如大块原石或特殊造型雕刻件则需千元以上。
粉水晶因颜色浪漫受喜爱，价格与颜色浓度、晶体净度直接相关。浅粉色、棉絮较多的普通粉水晶手链，价格约80-200元；颜色浓郁如“马粉”、晶体通透的，手链价格在200-500元，吊坠或雕刻件可达500-1500元；罕见的“星光粉水晶”有六道星芒效应，视品质不同，价格从2000元到上万元不等。
紫水晶的价格因产区和成色差异较大。普通紫水晶如国产紫水晶晶体略浑浊、颜色较浅，手链价格约100-300元；中等品质的巴西紫水晶，颜色均匀、半通透，手链300-800元，吊坠500-1500元；乌拉圭紫水晶因颜色深邃如“乌拉圭紫牙乌”、晶体纯净，价格显著更高，手链800-3000元，优质雕刻件或原石可达数万元。
黄水晶与茶水晶价格相对平稳。普通黄水晶手链颜色偏浅、有棉絮价格80-200元，颜色深浓如“巴西黄水晶”、晶体通透的手链200-600元，雕刻件500-2000元；茶水晶因产量较大，价格多在50-300元手链，深色“墨晶”或特殊包裹体品种，价格可升至几百元至上千元。
高端天然水晶中，碧玺、钛晶、绿幽灵等价格较高。碧玺按颜色和净度计价，普通红碧玺、蓝碧玺手链单珠直径8mm左右价格1000-3000元，优质“鸽血红”“帕拉伊巴蓝”碧玺按克计价，每克800-5000元；钛晶因内部有金色发丝状包裹体，普通品质手链2000-5000元，发丝密集、排列整齐的收藏级钛晶，价格可达万元以上；绿幽灵以“聚宝盆”绿色包裹体呈层状分布为贵，普通绿幽灵手链1000-3000元，优质聚宝盆或形态独特的雕刻件，价格从5000元到数万元不等。
总体而言，天然水晶价格从几十元的入门饰品到数万元的收藏级藏品不等，选购时需结合品种、晶体品质及个人需求综合判断。