北京两限房的分布与城市发展规划、人口疏政策密切相关，主要集中在城市功能拓展区、发展新区及部分生态涵养区，以保障中低收入家庭的住房需求。
在城六区中，朝阳区的两限房项目多分布在东坝、豆各庄、常营等区域，如常营乡的“常营家园”、豆各庄的“京城雅居”等，这些区域靠近地铁线路，交通相对便利。海淀区的两限房则集中在北部地区，如上地、西二旗、温泉镇，例如“温泉凯盛家园”“西二旗西路项目”，紧邻科技园区和高校资源。丰台区作为城六区中面积较大的区域，项目分布较广，包括卢沟桥、大红门、花乡等地，如“大红门锦苑”“卢沟桥南里”等，部分项目临近南四环，配套设施逐步善。
城市发展新区是两限房布局的重点区域。通州区作为城市副中心，两限房项目主要集中在梨园、台湖、宋庄等地，如“梨园北街项目”“台湖家园”，依托副中心建设，交通和教育资源持续升级。顺义区的两限房多分布在仁和、马坡、后沙峪，靠近机场高速和地铁15号线，如“仁和花园”“后沙峪新城”。昌平区的项目集中在回龙观、南口、北七家，如“回龙观西区”“北七家限价房小区”，临近上地信息产业基地和生命科学园。大兴区则以黄村、西红门、旧宫为核心，如“黄村东里”“西红门家园”，部分项目毗邻大兴国际机场临空经济区。
生态涵养区的两限房项目相对较少，但仍有布局。门头沟区的项目集中在永定镇、龙泉镇，如“永定家园”，依托西山国家森林公园，生态环境优越。房山区的两限房分布在长阳、良乡、窦店，如“长阳半岛”“良乡大学城项目”，靠近房山线地铁，连接市中心。
此外，部分远郊区县如怀柔、密云、延庆也有少量两限房项目，主要位于区县政府所在地或交通枢纽附近，如怀柔的“雁栖家园”、密云的“果园新村”等，以满足当地中低收入家庭的住房需求。
总体来看，北京两限房的分布呈现“向外疏、多点布局”的特点，优先选择交通便利、配套逐步善的区域，兼顾城市发展与民生保障的平衡。