《爱丽丝学园》作为经典的校园奇幻作品，自动画版2004年播出后便积累了大量粉丝。关于是否存在“第二部”，目前官方并未推出TV动画第二季。动画版仅改编了原作漫画前50话内容，故事停留在主人公佐仓蜜柑与伙伴们在学园中的初期冒险，许多深层谜团和角色成长尚未展开。
漫画原作则有着更整的剧情线。樋口橘创作的《爱丽丝学园》漫画共20卷，于2013年结，涵盖了蜜柑发现身世真相、对抗学园阴谋、与朋友们共同成长的整故事。虽然漫画没有明确分“第一部”“第二部”，但其和剧情深度远超动画版，因此常被粉丝视为“整版本”。
动画未推出续作的原因可归结为多方面：早期动画播出时原作尚未结，剧情改编空间有限；后期漫画情节趋于复杂，涉及更多战斗与阴谋元素，与前期的轻松校园风格差异较大，市场考量可能影响了续作开发。此外，制作公司的企划调整、声优阵容重组等因素也可能导致续作难产。
尽管官方未宣布动画第二季，但漫画的整结局为故事画上了句号。蜜柑与日向枣的羁绊、学园背后的秘密、角色们的最终归宿等内容，均在漫画中得到充分展现。对于希望了后续剧情的观众，阅读原作漫画仍是最佳选择。
目前，《爱丽丝学园》的后续动态仍以原作漫画为核心，尚动画续作的官方消息。但作品所传递的友情、成长与勇气，依然让它在粉丝心中保持着独特的地位。