《西出玉门》讲述了一个融合奇幻与冒险的故事。女主角叶流西是个身份成谜的女子，她在沙漠中醒来，失去了所有记忆，手腕上却戴着一串特殊的玉珠。为了找回身份，她偶然结识了曾在沙漠中失去队友的向导昌东，两人达成协议，一同前往传说中神秘的玉门关。
玉门关并非普通的历史遗迹，而是一个现实世界与奇幻领域的交界点。叶流西很快发现自己与这个神秘领域有着千丝万缕的联系——她是唯一能自由出入玉门关的人。进入关后，他们发现这里是一个独立的空间，存在着各种奇特的生物和部落，既有会操控沙暴的皮影人，也有依靠水源生存的村落。
随着探险深入，叶流西的身份逐渐揭晓：她原是关内“蝎眼”组织的首领，因一场权力斗争被陷害，失去记忆后流落到关外。昌东也发现，当年导致他队友遇难的沙暴，正是关内势力争斗的结果。两人在共同面对关内各方势力的追杀和诡异生物的袭击中，逐渐产生了信任和感情。
故事中，叶流西不仅要找回失去的记忆，还要夺回属于自己的权力，同时揭露关内残酷的生存法则。她与昌东携手，对抗控制水源的“龙家”，破皮影人的秘密，最终在关内掀起一场改变格局的变革。随着真相层层揭开，玉门关的起源、关内人的由来以及两个世界的联系也逐渐浮出水面。
在经历一系列惊心动魄的冒险后，叶流西成功整合关内势力，了长期的混乱局面。她与昌东最终选择留在关内，守护这个既危险又充满生机的独特世界，同时寻找两个世界和平共存的可能。整个故事在沙漠的壮阔背景下，交织着奇幻设定、权力斗争与人性挣扎，展现了主角在绝境中寻找自我、坚守信念的历程。