学科上，经济学院、管理学院、人文学院、新闻传播学院 等文科与社科类学院集中于此，同时也是学校行政中心和主要对外交流窗口。学生群体以高年级本科生、研究生为主，校园活动密集，学术氛围活跃，是厦大精神与文化的发源地。
翔安校区：理工科与医学高地 翔安校区位于厦门市翔安区，2012年正式启用，是厦大面向未来发展的现代化新校区。校区占地规模大，设施先进，重点布局医学、生命科学、海洋科学、环境科学与工程、航空航天等理工科领域，拥有国家级科研平台如近海海洋环境科学国家重点实验室、分子疫苗学与分子诊断教育部重点实验室等。与思明校区的古典风格不同，翔安校区建筑现代简约，实验楼、实验室集群善，更重科研与实践结合。学生以理工科本科生、研究生及医学院学生为主，校区内还设有厦门大学附属翔安医院，实现“教学-科研-临床”一体化。
漳州校区：独立学院与基础教学基地 漳州校区位于福建省漳州市龙海区，曾是厦大低年级本科生教学基地，现主要为厦门大学嘉庚学院独立学院所在地。校区环境清丽，建筑以现代风格为主，教学设施齐全，侧重应用型人才培养。与前两个校区相比，漳州校区管理相对独立，学生群体以嘉庚学院本科生为主，课程设置更贴近市场需求，重实践能力培养，为学生提供差异化的教育路径。
各校区虽定位不同，但共享厦大优质教育资源，通过跨校区选课、科研协作等机制实现联动。论是思明的人文底蕴、翔安的科研实力，还是漳州的应用型培养，都共同构成了厦门大学多维度、多层次的办学体系。