新角色方面，蔡思贝饰演的窦亚希以卧底身份渗透进长兴集团，与爆Seed成为表面上的竞争对手。随着调查深入，窦亚希发现韦作荣不仅是商业巨鳄，更与黑警网络有着千丝万缕的联系。剧中“长兴集团权力洗牌”成为核心事件，韦作荣通过连环计除掉社团元老，逐步掌控整个犯罪帝国。
剧情中段，爆Seed与卓凯的“师徒对峙”引发观众热议。爆Seed因好友速龙牺牲性情大变，一度游走在黑白边缘，甚至与卓凯产生信任危机。而韦作荣的真实身份——前警务处长之子——被揭开，他因童年阴影对警队怀恨在心，策划了一系列报复行动。
高潮部分，“卧底名单泄露”事件导致多名探员身份暴露，卓凯被迫启动“暗夜计划”。窦亚希在关键时刻暴露身份，与爆Seed联手对抗韦作荣。剧中“教堂枪战”戏码成为经典，三方势力激烈交火，韦作荣的右膀右臂魏德礼袁伟豪饰在此战中身亡。
结局以韦作荣的疯狂反扑收尾，他利用加密通讯系统操控全球犯罪网络，试图将卓凯、爆Seed等人一网打尽。最终，爆Seed在窦亚希协助下破系统，韦作荣在逃亡中被警方击毙。片尾彩蛋暗示“欢喜哥未死”，为第四季埋下伏笔。全剧通过“身份反转”“阵营博弈”等元素，延续使徒系列的烧脑风格，同时深化了角色的人性挣扎。