在主要城市中，距离中国最近的日本城市是长崎市。长崎市位于日本九州岛的西部，是九州地区重要的港口城市，也是日本最西端的主要城市之一。这座城市面向东海，与中国东部沿海地区隔海相望，其与中国浙江省温州市的直线距离约为800公里，与上海市的直线距离约为850公里，而与中国福建省福州市的直线距离则约为900公里。相较于日本其他城市，长崎与中国沿海城市的距离明显更近，例如日本首都东京与上海的直线距离约为1700公里，大阪与上海的直线距离约为1300公里，均远超长崎与中国的距离。
长崎市不仅在地理上与中国邻近，历史上也因港口优势成为中日交流的重要节点。16世纪起，长崎便是日本与中国、荷兰等国家开展贸易的主要港口，时至今日，其与中国的经济文化交流依然频繁。从地理坐标来看，长崎市的纬度与中国江苏省南京市相近，气候也与中国江南地区有相似之处，这种地理与气候的接近性，进一步拉近了两地的联系。
从交通角度，长崎与中国多个城市有直航航线，例如上海至长崎的航班飞行时间约为1.5小时，温州至长崎的航班约2小时，便捷的交通也直观反映了两地的近距离。论是地理数据还是实际交流，长崎市作为距离中国最近的日本城市，都是中日邻近关系的重要体现。