第一次交锋：死亡森林的初次对决第26集-第27集
中忍考试第二阶段“死亡森林”篇，大蛇丸伪装成音忍潜入木叶，目标是夺取佐助的身体。当鸣人、佐助、小樱遭遇音忍袭击时，大蛇丸现身并对佐助施加“天之咒印”。为保护同伴，鸣人首次爆发出九尾的查克拉，瞳孔变为竖直的兽瞳，指甲变长，力量与速度大幅提升。在第26集《不能错过！死之森林进入前报道！这是木叶的学级新闻！》 ，大蛇丸对鸣人出手，试图用强大的忍术压制他；而第27集《第二场考试开始！周围都是敌人！》 中，战斗正式展开：鸣人凭借九尾查克拉硬抗大蛇丸的攻击，甚至逼得大蛇丸不得不使用“潜影蛇手”反击。不过，此时鸣人的尾兽力量尚未全掌控，最终被大蛇丸用“五行封印”暂时封住九尾查克拉，战斗以鸣人昏迷告终。这场对决让大蛇丸首次意到鸣人体内的“特殊力量”，为后续剧情埋下伏笔。
第二次交锋：终结之谷前的四尾激战第134集
随着剧情推进，佐助为追求力量决定叛逃木叶，前往投靠大蛇丸。鸣人得知后独自追至终结之谷前的大桥，却遭遇早已等候的大蛇丸。此时的鸣人因愤怒和对同伴的执念，彻底失控，爆发出四尾状态——身体被九尾的红色查克拉包裹，形成巨大的尾兽外衣，失去理智只保留战斗本能。 第134集《泪的咆哮！你是我的朋友》 中，这场战斗达到白热化：四尾鸣人的力量足以撕裂大地，仅靠拳头和尾兽玉就能重创周围环境。大蛇丸不得不使出“三重罗生门”防御，却仍被尾兽查克拉击碎，连手臂都被九尾的毒素侵蚀后续导致大蛇丸法使用左手。尽管鸣人展现出压倒性力量，但因失去意识，最终被大蛇丸用“草雉剑”刺伤，战斗以双方两败俱伤收场。这场对决让大蛇丸意识到鸣人的潜力远超预期，称他为“有趣的容器”。这两场战斗分别对应第26集、第27集和第134集，不仅是鸣人与大蛇丸的直接对抗，更见证了鸣人从“吊车尾”到掌控尾兽力量的成长历程，成为《火影忍者》早期剧情中不可错过的经典片段。