故事始于米花图书馆的闭馆时间，少年侦探团柯南、步美、光彦、元太因寻找《假面超人》漫画未借到，决定留在图书馆“探险”。期间，他们意外发现图书馆馆长玉田顺三失踪，且馆内书架上的《怪物之书》被偷偷替换成了毒品。柯南通过细节推理——书架上书籍数量异常、电梯超重却人、馆长办公室的血迹，逐渐锁定凶手正是失踪的馆长本人。
最令人印象深刻的情节，是少年侦探团被困图书馆后，柯南发现 尸体被藏在电梯顶部 的真相。当电梯缓缓上升，柯南抬头望见天花板缝隙中露出的馆长鞋子，配合馆长狰狞的表情特写，成为许多观众的“童年阴影”。而凶手 玉田顺三 的动机，则是为掩盖自己利用图书馆走私毒品的罪行，杀害了发现秘密的同事津川秀治。
这一集凭借“密闭空间+儿童视角”的设定，将悬疑与恐怖感拉满：漆黑的图书馆、突然熄灭的灯光、电梯里的惊悚发现，再加上柯南冷静推理与少年侦探团慌乱反应的对比，让剧情张力十足。作为早期动画原创案件，它没有依赖漫画原作的复杂诡计，却以贴近日常的场景和“细思极恐”的细节，成为《名侦探柯南》中不可忽视的经典篇章。
若想重温这场发生在图书馆的惊险案件，直接搜索《名侦探柯南》第50集 即可。