大蛇丸曾是木叶三忍之一，因沉迷禁术、追求永生而叛逃，他视佐助为美的“容器”，企图通过夺取其身体实现永恒生命。为此，他精心培养佐助多年，甚至在佐助体内种下咒印。然而，随着佐助实力的成长与心智的成熟，他逐渐看清大蛇丸的本质——与其成为附庸，不如将其力量化为己用。
第358集中，佐助主动找到大蛇丸，以“接受身体移植”为名发起对决。此时的佐助已掌握写轮眼与咒印的双重力量，更在与鼬的对抗中领悟了须佐能乎的雏形。面对大蛇丸释放的八岐大蛇，佐助以咒印反噬大蛇丸，将其本体与意识彻底封印于自己体内。大蛇丸的意识在佐助的精神世界中挣扎，最终被佐助的意志压制，象征着他作为独立个体的“死亡”。
值得意的是，大蛇丸后来因药师兜的秽土转生之术短暂重现，又在第四次忍界大战中协助忍者联军，甚至在《博人传》中以“科学家”身份回归。但这些情节均基于其被封印后的力量残留或特殊术式，严格意义上，大蛇丸作为反派的“死亡”节点，仍是《火影忍者疾风传》第358集——这一集中，他失去了对自身命运的掌控，彻底沦为佐助成长的垫脚石。