在经济运行逻辑层面，社会主义实行计划与市场相结合的调节机制，国家通过宏观调控引导资源配置，确保经济发展服务于社会整体利益，避免周期性经济危机和两极分化。资本主义则依赖市场自由调节，资本追逐利润的本性导致生产盲目扩张与消费能力不足的矛盾，周期性爆发经济危机成为其制度痼疾。社会主义的“有效市场+有为政府”模式，本质上是为了克服资本序扩张的弊端，而资本主义的市场原教旨主义则将资本逻辑凌驾于社会需求之上。
政治统治的本质差异体现在权力归属与服务对象上。社会主义建立在人民民主专政基础上，国家权力属于人民，通过全过程人民民主保障劳动者的主体地位，政治制度服务于最广大人民的根本利益。资本主义则是资产阶级专政，国家机器本质上维护资本所有者的利益，金钱政治、利益集团游说等现象导致权力被资本异化，普通民众的政治参与度被严重削弱。
价值追求的根本目标决定了两种制度的发展方向。社会主义以实现共同富裕为价值核心，通过放和发展生产力消除剥削，最终目标是迈向共产主义社会。资本主义则以资本增殖为终极目标，社会福利和公平正义只是资本积累的附属品，法从根本上决贫富分化问题。这种价值差异导致社会主义更重社会整体进步，而资本主义则不可避免地陷入“资本与劳动对立”的历史困境。这些本质区别不是表面政策的差异，而是由生产关系基础决定的制度属性差异，决定了两种社会形态的不同历史命运和发展道路。