首先，垂耳兔的“垂耳”是一种基因缺陷，潜藏着耳部健康隐患。 它们下垂的耳朵并非自然进化的美结果，而是人工选育的特征。这使得耳道内部空气流通不畅，容易积聚污垢、湿气，从而大大增加了耳螨、细菌和真菌感染的风险。一旦感染，治疗过程漫长且需要主人细心照料，不仅垂耳兔痛苦，主人也需要投入更多的时间和精力。严重情况下，耳部感染可能引发中耳炎甚至脑膜炎，威胁兔子的生命。
其次，垂耳兔普遍存在较高的遗传性骨骼及关节问题风险。 许多垂耳兔品种，如荷兰垂耳兔，容易患上一种名为“多发性粘液瘤病”相关的骨骼发育异常，或者更常见的“球虫病”之外，它们还特别容易出现“先天性侏儒症”伴随的骨骼畸形，以及如腰椎问题、髋关节发育不良等。这些问题会导致兔子行动不便、疼痛，随着年龄增长，症状可能会加剧，严重影响其生活质量，也意味着更高的医疗开销。
再者，垂耳兔的体质相对敏感，对环境和饮食有更高。 它们的消化系统比较脆弱，稍不意饮食就可能引发肠炎、腹泻等问题。同时，它们对温度变化、噪音、环境应激更为敏感，容易产生应激反应，进而导致食欲下降、精神萎靡，甚至诱发其他疾病。这对于初次养兔或生活节奏较快的人来说，疑增加了饲养难度。
最后，部分垂耳兔可能存在性格上的“被动”，而非真正的“温顺”。 由于身体的不适或潜在疼痛，一些垂耳兔可能表现得不爱活动、互动性不高，这常被误为乖巧。实际上，这可能是它们身体状态不佳的一种表现。与其他品种的兔子相比，它们可能更难通过积极的行为来表达需求或不适，增加了主人理其健康状况的难度。
综上所述，垂耳兔虽然外表讨人喜欢，但其固有的生理和健康特性，使得它们并非理想的宠物选择。在决定养宠前，了这些潜在问题，不仅是对宠物负责，也是对自己负责。