从原料来看，酸奶以牛奶为主要原料，经乳酸菌发酵制成，保留了牛奶中的优质蛋白质、钙及多种营养成分，国家标准蛋白质含量≥2.9g/100g，钙含量约100mg/100g，是钙和蛋白质的优质来源。而乳酸菌饮料以水为基底，添加乳粉、糖、乳酸菌及其他添加剂如香精、甜味剂，蛋白质和钙含量远低于酸奶，多数产品蛋白质含量≤1g/100g，钙含量不足30mg/100g，营养价值更接近“含糖饮料”。
从益生菌活性看，活性乳酸菌饮料需全程冷链保存以维持益生菌活性，常温乳酸菌饮料则经过灭菌处理，益生菌多已失活；酸奶中的益生菌在发酵过程中自然产生，稳定性更强，且多数产品需过度依赖冷链也能保留部分活性。此外，乳酸菌饮料为改善口感，往往添加大量 sugar部分产品含糖量≥10g/100g，长期饮用可能增加肥胖、龋齿风险，而酸奶含糖量普遍较低，且富含优质蛋白，更适合日常营养补充。
二、乳酸菌饮料过期了还能喝吗？ 不能喝。过期的乳酸菌饮料存在多重安全风险，不存在“稍微过期没关系”的情况。首先是微生物超标风险。乳酸菌饮料富含水分、糖分和少量蛋白质，是微生物良好的“培养基”。过期后，包装内的益生菌会逐渐失活，而有害菌如大肠杆菌、霉菌可能大量繁殖，饮用后易引发腹胀、腹泻、呕吐等肠胃不适，严重时可能导致食物中毒。
其次是营养成分变质。过期后，饮料中的蛋白质、维生素等营养成分会氧化分，不仅失去原有的营养价值，还可能产生过氧化物、醛类等有害物质，影响健康。
最后是包装安全隐患。部分乳酸菌饮料采用塑料瓶或利乐包装，过期后可能因内部气压变化导致包装膨胀、破损，进一步增加污染风险。即使外观异常，内部成分也已发生质变，法保证饮用安全。