该校专科教育依托学校深厚的中医药学科底蕴，开设专业紧密围绕中医药产业需求，重点涵盖针灸推拿、护理、中药学、康复治疗技术等领域。其中，针灸推拿专业重传统技法与现代康复技术结合，护理专业以中西医结合护理为特色，中药学专业中药材鉴定与炮制技能培养，这些专业均面向全国招生，学制多为三年。
专科教学由成都中医药大学附属医院针灸学校·四川省针灸学校具体实施，该校区拥有独立的教学设施和实训基地，共享学校的师资资源与附属医院临床资源。学生在校期间可参与职业技能等级证书考核，毕业后主要面向各级医疗机构、中医药企业、康养机构等从事技术服务工作，部分专业还提供专升本深造通道。作为中医药特色鲜明的高等院校，成都中医药大学专科教育始终坚持“立德树人、医教协同”理念，通过“理论教学+临床实训”的培养模式，为基层医疗和健康服务领域输送了大量实用型人才，其专业设置与行业需求的高度契合，使毕业生具有较强的就业竞争力。