第一个主要内涵是认知不确定性。它源于认知主体的知识局限与信息缺失，是因人类对事物运行规律的理尚不充分，或获取的信息存在偏差、不整而产生的不确定性。例如，在医学研究中，一种新型疾病的病因推断往往因早期病例数据不足而充满争议；在历史研究中，因文献记载的碎片化，对某一事件的具体过程可能存在多种读。这种不确定性并非事物本身的固有属性，而是随认知水平提升和信息补充可以逐步降低的——正如随着观测数据的积累，天气预报的准确率持续提高，本质上就是认知不确定性的消过程。
第二个主要内涵是本体不确定性。它独立于认知主体的主观状态，是事物本身固有的、由系统内在随机性或复杂性导致的不可全预测性。量子力学中的“测不准原理”是典型例证：微观粒子的位置与动量法同时被精确测量，这种不确定性并非测量技术的局限，而是量子世界的本质特征。在宏观层面，混沌系统如大气环流、股票市场对初始条件的敏感依赖性，使得长期预测成为不可能——即便掌握所有初始参数，微小的扰动也会导致系统演化路径的巨大偏差。这种不确定性法通过增加信息或提升认知能力消除，是世界复杂性的内在体现。
认知不确定性与本体不确定性共同塑造了人类面对的未知图景：前者提示认知的边界与进步的可能，后者揭示世界的深层随机性与不可控性。二者的区分不仅为科学研究提供了方法论指导，也为个体与社会应对风险、制定决策提供了重要的理论依据。