小星是青山镇小学四年级学生，性格活泼且观察力敏锐。一次雨后，他在河边发现大量塑料瓶漂浮，岸边草木发黄，连常去的“秘密基地”小树林也多了许多废纸垃圾。这一幕让他决心行动起来，与同班同学阿禾、小雨组建“绿芽小队”，共同调查污染源头，守护家乡环境。
剧情主线围绕“绿芽小队”的环保行动展开。他们先是通过走访社区老人，了到镇西的旧工厂常偷排废水，导致下游河流变质；接着发现居民垃圾分类意识薄弱，厨余垃圾与电池混放，污染土壤。面对这些问题，小星带领小队用实际行动应对：他们在社区设立“环保知识角”，通过“垃圾分类小课堂”“节水小妙招”等互动情节，向居民讲环保知识；利用周末组织“净滩行动”，用自制网兜打捞河面垃圾；甚至鼓起勇气向镇长反映旧工厂排污问题，最终推动工厂安装污水处理设备。
剧中穿插多个单元故事，如“拯救银杏树”——小队发现施工队为扩建停车场欲砍伐百年银杏，通过收集签名、制作保护海报，最终让银杏树被列为保护植物；“变废为宝大赛”——带领同学用废纸盒、旧布料制作手工艺品，倡导资源循环利用。每个故事都以“发现问题—团队协作—决问题”为脉络，既展现环保实践，也传递“小事汇成大力量”的理念。
随着剧情推进，青山镇的环境逐渐改善：浑浊的河流变得清澈，枯萎的草木重新发芽，居民主动参与垃圾分类，孩子们在草坪上放风筝的场景重回视野。小星和伙伴们也在过程中收获成长，学会沟通、坚持与责任。故事，“绿芽小队”在镇广场举办环保成果展，镇长为他们颁发“环保小福星”奖章，全镇居民共同宣誓：“守护青山，从我做起”。
全剧以轻松幽默的情节包裹环保主题，通过孩子视角让观众感受到保护环境的紧迫性与行动力，成为一部兼具教育意义与观赏性的动画作品。