首先，其核心问题在于缺乏坚实的科学依据。 现代医学早已明确，胎儿的性别是由男性精子中的性染色体决定的。当携带X染色体的精子与卵子结合，会孕育出女孩XX；而携带Y染色体的精子与卵子结合，则会孕育出男孩XY。这是一个基于生物学规律的随机过程，其概率在自然情况下大致接近1:1。清宫图所依据的母亲年龄、受孕月份等因素，与精子的染色体组成并任何科学上的关联，法影响或预测胎儿的性别。
其次，清宫图的“准确率”很多时候源于心理暗示和概率巧合。 由于生男生女的自然概率本就接近50%，论是否参考清宫图，总会有一部分人的结果“吻合”。加上人们往往更容易记住“准确”的案例，而忽略“不准确”的情况，这就形成了一种“幸存者偏差”，使得清宫图在部分人群中显得似乎“很准”。此外，清宫图的版本众多，推算方法也存在差异，这进一步降低了其所谓“准确率”的可信度。
清宫图更多的是一种历史遗留的文化现象，或是人们茶余饭后的趣味谈资。将其作为预测胎儿性别的依据，显然是不科学的。与其依赖这些没有根据的方法，不如更关孕期的科学保健和胎儿的健康发育。决定胎儿性别的是复杂的生物学过程，而非一张图表。