从中医角度看，凌晨1点到3点是肝经当令的时间。肝主疏泄，晚上本该是肝血修复、功能休息的时段。如果此时咳嗽，中医认为可能与“肝火犯肺”或“肝阴不足”有关。肝火过旺，容易向上熏蒸肺脏，导致肺失宣降，引发咳嗽；而肝阴亏虚，也可能导致虚火上炎，影响肺的正常功能，表现为夜间定时咳嗽，有时还可能伴有口干、咽干、烦躁等症状。
从现代医学角度分析，这个时间段人体迷走神经兴奋性较高。迷走神经兴奋会使气道平滑肌收缩，气道反应性增加，对于有哮喘、慢性支气管炎等基础疾病的人来说，容易在此时出现咳嗽、喘息等症状。此外，胃食管反流也是一个不容忽视的原因。当人处于平躺状态时，胃酸更容易反流至食管，甚至刺激咽喉和气管，引发咳嗽，这种咳嗽在夜间尤其明显，可能集中在某个特定时间段。
除了上述原因，一些心肺方面的潜在问题，也可能在夜间，特别是凌晨时分表现出咳嗽的症状，因为夜间人体血流动力学和神经调节等都可能发生变化，使得潜在的问题更容易显现。
因此，如果长期在凌晨1点到3点出现规律性的咳嗽，千万不要简单认为是小毛病而忽视。这种有特定时间规律的咳嗽，往往是身体发出的一种“预警”，提示我们需要关身体内部的平衡与健康状况。