2015年，宝能系通过前海人寿、钜盛华等平台连续举牌，从二级市场大量收购万科股票。短短半年内，其持股比例从0飙升至25%以上，取代华润成为万科第一大股东。这一突然的股权变动，直接冲击了万科长期以来"股权分散、职业经理人主导"的治理结构。王石作为万科的精神象征和实际控制者，与宝能系的矛盾迅速激化。
王石对宝能系的入主持明确反对态度。他公开质疑宝能系的资金来源与信用资质，称"宝能不配做万科大股东"，并万科需要"有信用、有担当"的股东。这种对抗姿态引发了宝能系的强烈反弹，双方在董事会席位、公司战略等问题上展开激烈博弈。宝能系多次提议召开临时股东大会，罢免王石等管理层成员，控制权争夺进入白热化。
与此同时，万科原第一大股东华润的立场变化也至关重要。面对宝能系的逼宫，华润起初选择支持王石团队，但随着矛盾升级，华润与万科管理层在引入深圳地铁等问题上产生分歧，最终放弃支持王石，导致管理层失去关键股东支撑。2016年，万科引入深圳地铁作为战略投资者，试图通过增发股票稀释宝能系股权，但这一方案因华润和宝能的联合反对未能通过，王石团队的筹码进一步减少。
2017年董事会换届成为关键节点。宝能系联合其他股东掌握了董事会提名权，王石团队在股权和席位上均不占优势。为避免公司陷入长期内斗，王石最终选择主动退出，以"体面"的方式了与万科的40年缘分。股权结构的彻底改变，让职业经理人主导的时代落下帷幕，王石的离开本质上是资本力量重塑万科控制权的必然结果。