富山县卫生部门接到报告后立即启动应急调查，通过对患者症状、饮食史及食品样本的检测，最终锁定中毒原因。调查结果显示，此次食物中毒事件的直接原因是摄入被肠炎弧菌污染的校供午餐。 卫生部门从涉事学校食堂提供的青花鱼样本中检测出高浓度肠炎弧菌，该批次青花鱼在冷链运输过程中因温控失效导致细菌大量繁殖，且食堂工作人员未按规定彻底加热，最终引发群体性中毒。
流行病学调查显示，所有中毒者均食用了当日午餐中的青花鱼菜品，未食用者异常症状。实验室检测同时排除了其他病原体及化学物质中毒的可能。进一步追溯发现，涉事食品供应商在青花鱼处理环节存在严重操作违规，其冷链运输车辆的温度记录显示，运输过程中冷藏温度多次超出安全范围，导致细菌滋生。
截至目前，大部分患者已通过对症治疗恢复健康，富山市政府已对涉事食品供应商采取停业整顿措施，并在全市范围内开展学校食品安全专项检查。