补习第3天，校园突然被不明人士封锁，通讯中断，学生与外界彻底隔绝。刺耳的广播声打破平静：“从现在开始，你们将参加一场特殊考试，答错或作弊者，死亡就是答案。”话音刚落，优等生尹娜被发现吊在教学楼旗杆上，尸体旁放着一张试卷，上面用血写着谜题：“她为何在微笑时死去？”——这正是补习开始前意外坠楼身亡的女生智媛的死亡场景。
随着死亡事件接连发生，学生们意识到死者都与智媛有关。智媛曾是班级里的“异类”，因拒绝参与同学的霸凌游戏被孤立，死前留下一本日记，记录了被排挤的痛苦。世熙和郭秀作为智媛仅有的朋友，决定开谜题找出真相。她们发现每张死亡试卷的题目都对应智媛生前的遭遇：被锁在器材室、被泼冷水、被恶意P图……而答案指向参与欺凌的学生。
补习班的车老师和黄老师试图保护学生，却发现自己也被卷入阴谋。车老师性格严厉，对学生苛刻，黄老师则温柔细心，暗中调查智媛的死因。当中等生贤儿被凶手用化学药品灼伤，临死前指向车老师办公室时，世熙突然想起：智媛坠楼当天，车老师曾与她在天台争执。
高潮时刻，所有幸存者被集中到礼堂，凶手通过广播揭露身份——车老师正是智媛的母亲。她隐瞒母女关系来到学校，就是为了替自杀的女儿复仇。智媛并非意外坠楼，而是被长期欺凌后不堪忍受，在天台跳楼身亡，而学校为保声誉压下真相，参与霸凌的学生毫愧疚。车老师精心设计“死亡考试”，让每个施暴者以智媛经历过的方式死去。
最终，警方突破封锁冲入校园，车老师在绝望中试图引爆煤气与学生同归于尽，被狙击手击毙。世熙翻开智媛的日记，最后一页写着：“如果有人记得我，我就不算真正死去。”阳光透过窗户照进教室，幸存的学生们沉默地看着彼此，暑假补习的阴影永远留在了他们心中。