东方航空公司在其运营历史中发生过数起事故，其中较为重大的包括以下几次：
1989年8月15日，东方航空5510号航班机型BAe 146-300，册号B-2716执行上海虹桥至南昌的航班任务，在南昌昌北机场进近时因机组操作不当导致飞机失速坠毁，机上40人全部遇难。
1993年10月26日，东方航空583号航班机型MD-11，册号B-2171执行上海至洛杉矶的航班任务，在太平洋上空巡航时因机组误操作放下前缘缝翼，导致飞机急速下降，造成2名乘客死亡，149人受伤。
2004年11月21日，东方航空5210号航班机型CRJ-200，册号B-3072执行包头至上海的航班任务，在包头机场起飞后不久坠毁，机上53人全部遇难，地面1人受伤。经调查，事故原因是飞机起飞过程中，机翼结冰导致升力不足。
2022年3月21日，东方航空MU5735航班机型波音737-800，册号B-1791执行昆明至广州的航班任务，在广西梧州藤县上空失联并坠毁，机上123名乘客和9名机组人员全部遇难。事故调查结果显示，飞机在巡航阶段突然下降，最终撞地，具体原因仍在技术分析中。
以上是东方航空历史上发生的主要事故，每起事故都给航空安全工作敲响了警钟，推动行业不断善安全管理体系。