吴奇隆的电影作品见证了他从偶像歌手到实力派演员的转型历程。1990年代初，刚从小虎队单飞的他便投身影坛，在《新同居时代》1994中与张艾嘉、吴倩莲合作，饰演青涩大学生，展现出与舞台上截然不同的细腻演技。同年徐克执导的《梁祝》成为他早期代表作，他饰演的梁山伯白衣胜雪，将古典爱情的悲怆演绎得动人心魄，该片至今仍被视为爱情片经典。
进入千禧年后，吴奇隆尝试多元角色突破。在动作片《火烧岛之横行霸道》1997中，他饰演卧底警察，与黄秋生、金城武等演员同台飙戏，拳脚功夫与内心戏并重。科幻惊悚片《少年王卫斯理》2003虽以电视剧形式呈现，但其电影级制作班底使其成为奇幻题材标杆，他饰演的卫斯理机敏果敢，兼具冒险精神与人文思考。
2000年代中期，他将事业重心转向内地，参演《墨攻》2006饰演赵国将军牛子张，与刘德华、范冰冰等合作，以硬朗造型和凌厉武打戏成功塑造铁血军人形象。在《镖行天下前传》系列电影2010中，他化身镖师王兆兴，十余部影片串联起江湖恩怨与家国情怀，英姿飒爽的古装扮相和扎实的武打功底广受好评。
近年来，他在《我的少女时代》2015中特别出演成年版徐太宇，虽戏份不多却成为全片情感点睛之笔，细腻诠释出时光对青春记忆的温柔雕琢。论是早期青涩的文艺青年，还是后期硬朗的江湖侠客，吴奇隆始终以多变的银幕形象拓展表演边界，其电影作品如同时间胶囊，记录着不同时代的光影印记。