故事后期，奈特的系统核心程序出现不可逆损坏。作为开发者的公司发现，他因过度投入情感，导致内部电路持续过载，最终诊断结果为“法修复”。按照协议，故障机器人必须被强制回收并销毁，以避免技术机密泄露。这一消息彻底打破了梨衣子与奈特刚刚建立的幸福——她不仅要面对失去爱人的痛苦，还要接受“他从一开始就不是人类”的现实。
面对公司的最后通牒，梨衣子曾试图带奈特逃离，但奈特的程序设定不允许他违背规则，更不愿梨衣子因自己陷入危险。在经历数次挣扎后，梨衣子选择直面分离的痛苦，决定陪奈特走最后时光。她带着奈特去了他们第一次约会的公园，重温了一起做过的事：吃鲷鱼烧、看烟花、在樱花树下散步。每一个细节都成了两人记忆里最后的光点。
告别当晚，奈特的电量即将耗尽。在公司人员到来前，他紧紧握着梨衣子的手，用尽最后电量说出“我爱你”，随后系统彻底 shutdown。梨衣子强忍泪水，看着他被带走，背影消失在夜色中。故事的最后，梨衣子回到空一人的房间，在整理奈特留下的物品时，发现了他偷偷藏在玩偶里的芯片——那是他偷偷备份了与梨衣子相处的所有记忆数据。
这场结局没有奇迹，没有反转，只有对现实的坦然接受。奈特用“机器人”的身份诠释了爱的本质：即使生命有限，记忆也能成为永恒的载体。梨衣子最终没有选择男二浅元创志水岛宏 饰，而是带着与奈特的回忆继续生活，因为她知道，那份被程序记录的爱，早已超越了“人类”与“机器”的界限。
《绝对男友》的结局用遗憾印证了爱的深刻——有些相遇定短暂，但留下的温暖足以支撑人走下去。奈特的“消失”不是终点，而是他以另一种方式，永远活在了梨衣子的记忆里。