2009年的约事件是组合变动的核心原因。三名成员以"奴隶合约"为由提起诉讼，指控SM公司存在收入分配不公、合约期限过长13年、限制个人发展等问题。当时诉讼引发韩国娱乐圈对艺人合约制度的广泛讨论，最终法院裁定SM公司与三人的专属合约部分效。这一事件直接导致东方神起从五人组转变为二人组，但郑允浩和沈昌珉选择留在SM公司，继续使用东方神起的名称进行演艺活动。
尽管经历成员变动，东方神起作为二人组合仍保持着活跃的音乐活动。2011年推出的《Keep Your Head Down》标志着二人组的正式重启，此后陆续发行了《Catch Me》《TENSE》等多张专辑，在韩国及日本市场均取得亮眼成绩。其韩国演唱会动员能力和日本红白歌会的连续出演记录，证明了组合在亚洲乐坛的持续影响力。
从法律层面看，东方神起的商标权仍归SM公司所有，郑允浩与沈昌珉的活动具有合法性。而离开的三名成员虽法再使用东方神起名义，但通过JYJ继续演艺事业。这种特殊的"双轨发展"模式，使得东方神起这一品牌以不同形式延续至今，成为韩国偶像团体发展史上的独特案例。
如今的东方神起已形成稳固的二人体系，郑允浩和沈昌珉在音乐风格上更重成熟感与舞台表现力，持续推出作品并举办世界巡演。这种历经风波后的重生，既保留了团体的历史传承，也展现了成员在不同人生选择下的各自发展。