战斗初期，团藏展现出右臂的十一只写轮眼，通过频繁使用禁术“伊邪那岐”规避佐助的致命攻击。这种能够将现实转化为梦境的瞳术让他多次死里逃生，但每次使用都会消耗一只写轮眼。佐助则以万花筒写轮眼的“加具土命”与“须佐能乎”持续压制，最终迫使团藏耗尽所有写轮眼的能量。
当最后一只写轮眼失去光泽时，团藏意识到败局已定。为了销毁根部的秘密资料并阻止佐助继续威胁木叶，他发动了禁术“里四象封印”。这个以生命为代价的术式在体内形成巨大的黑色球体，试图将周围一切物质彻底吞噬。尽管佐助在千钧一发之际被宇智波带土的“神威”转移，但团藏本人却被封印术的能量全吞噬，最终化为碎片消散在空气中。
临终前，团藏紧握手臂上的初代火影细胞，口中仍念叨着“忍者”与“村子”的存在意义，其复杂的立场与悲剧性结局成为火影剧情中极具争议的一幕。