玄武湖校区主校区
玄武湖校区是南京林业大学的核心校区，位于南京市玄武区龙蟠路159号，紧邻玄武湖和紫金山，地理位置优越。作为学校的主校区，这里集中了大部分教学院系、科研机构、图书馆、行政中心及主要生活设施，承担着学校本科、研究生教育的核心教学任务和重点科研项目。校区内林木葱郁，建筑与自然环境融合，形成了独特的"林大特色"校园景观，是师生日常学习、科研和生活的主要场所。新庄校区
新庄校区与玄武湖校区相邻，位于南京市玄武区新庄附近，两校区通过内部道路相连，形成有机整体。该校区主要承担部分院系的教学实验、实习实训以及后勤保障功能，设有部分实验室、实训基地和学生宿舍，进一步拓展了主校区的办学空间，为师生提供了更多教学资源和生活便利。淮安校区
淮安校区位于江苏省淮安市清江浦区枚皋路1号，是学校服务地方发展、拓展办学空间的重要布局。校区以培养应用型人才和开展产学研合作为主要目标，开设部分本科专业，面向区域经济社会需求设置课程，重实践教学和应用能力培养。淮安校区的建设不仅扩大了学校的办学规模，也为当地教育和产业发展提供了人才支持。三个校区各有侧重、协同发展，共同支撑南京林业大学的人才培养、科学研究和社会服务使命，形成了"一校三区"的办学格局。