清华附中朝阳学校
成立于2010年，位于北京市朝阳区新源里，是清华附中与朝阳区合作创办的公办全中学。学校传承清华附中“自强不息、厚德载物”的校训，融合本部课程体系与朝阳教育特色，开设人文、科技、艺术等多元课程，2022年入选北京市示范性普通高中。清华附中上地学校
2006年由清华附中合并原上地中学组建，地处海淀区上地信息产业基地。作为清华附中“一体化”管理的分校，学校共享本部师资培训、教研资源，重点发展科技教育，开设机器人、人工智能等特色课程，连续多年获海淀区教育教学优秀奖。清华附中永丰学校
2013年在海淀区永丰地区创办，是一所集小学、初中、高中于一体的十二年一贯制公办学校。学校依托清华附中“基础+创新”的课程理念，打造“科技+艺术”双特色，拥有北京市首批高中科技特长生培养基地。清华附中奥森公园学校
2019年落地朝阳区奥森公园旁，为九年一贯制公办学校。学校以“生态教育”为核心理念，结合奥森公园自然环境开发户外课程，同时引入清华附中“阅读素养提升计划”，是朝阳区首批“家校社协同育人”试点校。清华附中昌平学校
2021年在昌平区未来科学城建成，含小学至高中三个学段。作为清华附中服务北京城市副中心建设的重点分校，学校聚焦“科技赋能教育”，开设航天科技、大数据等前沿课程，与清华大学相关院系共建实验室。 外省市分校清华附中合肥学校
2020年启用，位于合肥经济技术开发区，是安徽省与清华大学合作的重点教育项目。学校采用“小学+初中+高中”十二年一贯制模式，引入清华附中“马约翰体育特色课程”，2023年首次参加高考即实现一本率90%以上。清华附中郑州学校
2018年落户郑东新区，由郑州市政府与清华附中联合创办。学校涵盖幼儿园至高中全学段，以“书院制”管理为特色，设立致知、明德等六大书院，推动个性化教育。清华附中贵阳学校
2014年在贵阳观山湖区开学，是贵州省首个“清华系”公办学校。学校传承清华附中“全面发展+个性成长”理念，开设民族文化课程和STEAM课程，连续多年稳居贵阳市中考、高考前列。清华附中嘉兴学校
2021年在嘉兴南湖区建成，含小学、初中、高中三个学段。作为长三角一体化教育合作项目，学校与清华附中本部实现教研同步、资源共享，重点发展科技创新和国际理教育。此外，清华附中还在广东东莞、云南昆明等地设有分校，各分校均保持与本部一致的办学标准，通过输出管理团队、共享课程资源、联合教研等方式，推动当地教育质量提升。这些分校不仅是清华附中教育理念的延伸，也成为区域基础教育发展的重要力量。