故事的核心线索，是前检察官江阳与刑警朱伟、律师张超等人，为翻案奔走十年的历程。他们要揭露的，是十年前支教老师侯贵平因撞见企业老板孙红运性侵幼女而被灭口的真相，以及背后层层相护的官场保护伞。这场战斗的终点，以江阳的死亡为引爆点——他选择用自杀伪造他杀现场，将自己的“尸体”作为最震撼的证据，迫使警方和舆论不得不重启调查。他精心设计了每一个细节：让张超“运输”尸体至地铁人流量最大的站点抛尸，故意留下矛盾的供词，引导警方发现他生前藏匿的关键证据链。
随着调查深入，十年前的黑暗被逐层剥开：侯贵平拍摄的性侵照片、孙红运与胡一浪的杀人录音、市公安局副局长李建国销毁证据的记录、前省委常委夏立平充当保护伞的转账凭证……所有线索最终指向以夏立平为核心的利益集团。省级调查组的介入，让这场被掩盖十年的冤案迎来转折点：孙红运、胡一浪等直接凶手被判处死刑，李建国因包庇罪、故意杀人罪被枪决，夏立平在证据确凿后畏罪自杀，其他参与包庇的官员也被一一清算。
但正义的到来，是以数人的破碎为代价：侯贵平的生命永远定格在二十岁，江阳从前途量的检察官熬成满身伤病的废品收购员，最终用死亡换取关；朱伟被陷害入狱三年，出狱后继续追查却差点付出生命；张超放弃律师事业配合演戏，陈明章散尽家产资助调查，甚至江阳的妻子郭红霞也带着孩子承受了十年的压力。他们像飞蛾扑向黑暗，用血肉之躯撞开了一丝裂缝。
大结局没有渲染廉价的“光明战胜黑暗”，而是直面现实的残酷：当漫长的黑夜终于透出光亮，那些在黑暗中燃烧自己的人，却再也看不到黎明。江阳的名成为城市传说，侯贵平的案子被写入教材，但他们失去的人生永远法重来。这不是一个“圆满”的结局，却是最真实的结局——正义或许会迟到，但追寻正义的人，早已在长夜里燃尽了自己。