虽然台风山竹的登陆点并非直接在深圳，但作为距离登陆点约150公里的沿海城市，深圳在台风登陆前后遭受了严重影响。9月16日白天至夜间，深圳出现持续的狂风暴雨天气，全市平均风力达到10-12级，部分地区最大阵风达16级以上，最大小时降雨量超过50毫米。台风带来的风暴潮导致深圳沿海地区出现海水倒灌，部分低洼路段被淹没，树木倒伏、广告牌脱落等情况较为普遍，对城市交通、电力供应和市民生活造成显著影响。
早在台风登陆前，深圳市政府已启动最高级别的防风应急响应，全市停工、停业、停市、停课，并组织危险区域人员转移。台风登陆期间，深圳全市进入紧急防御状态，气象部门持续发布台风红色预警信号，提醒市民留在安全区域。尽管山竹并未直接登陆深圳，但其外围环流和强风圈仍对这座城市造成了严重冲击，成为2018年影响深圳最显著的自然灾害事件之一。
台风山竹的移动路径和强度变化受到副热带高压和季风环流的共同影响，其登陆时间和地点的精准预报为防灾减灾工作争取了宝贵时间。此次台风过后，深圳进一步加强了城市防风基础设施建设和应急预案善，以提升应对极端天气事件的能力。