马尾校区靠近福州经济技术开发区，周边医疗资源丰富，与多家社区卫生服务中心、医院建立合作关系，为学生提供贴近临床的实践机会。校区内还设有图书馆、学生公寓、运动场馆等生活配套设施，满足师生日常学习与生活需求。
闽侯校区：现代化新校区与主教学区 闽侯校区位于福州市闽侯县荆溪镇，是学校的新建主校区，总建筑面积达18万平方米，于近年投入使用，整体布局更具现代化与专业化。校区以“医教融合”为设计理念，建有高标准的教学大楼、实验实训楼、模拟医院、学术报告厅等，教学设备先进，实训条件一流。作为主教学区，闽侯校区集中了学校大部分院系与专业，如护理系、药学系、医学技术系、健康管理系等，承担主要的理论教学与核心实训任务。校区内还设有省级职业技能实训基地、虚拟仿真实验中心，为学生提供“仿真临床”的实践环境，助力培养高素质技术技能型卫生人才。
闽侯校区交通便利，临近福州绕城高速，校园环境优美，绿化覆盖率高，为师生营造了良好的教学生活氛围。
两个校区虽定位不同，但通过资源共享与协同管理，共同支撑学校的人才培养体系，为福建省医疗卫生事业发展输送了大批优秀人才。