秦琼早年在隋军服役，先后追随来护儿、张须陀等将领，以勇武闻名。隋末乱世中，他辗转于瓦岗军、王世充麾下，最终归顺李唐，成为李世民麾下核心将领。他参与破宋金刚、擒窦建德、降王世充等战役，为唐朝建立立下赫赫战功，被封为翼国公。玄武门之变后，秦琼因功拜左武卫大将军，食实封七百户。
由于常年征战，秦琼晚年伤病缠身。《旧唐书》记载他曾自言：“吾少长戎马，所经二百余阵，屡中重疮。计吾前后出血亦数斛矣，安得不病乎？”贞观年间，他逐渐淡出军政舞台，于贞观十二年病逝，陪葬昭陵。
尽管史书中未明确记载秦琼的具体生年，但通过对其早年经历的考证，结合唐代官员致仕年龄及同期人物寿命推断，57岁是较为合理的结论。这一寿命在古代武将中属于正常范围，与其常年征战、积劳成疾的经历相符。秦琼死后，唐太宗追赠其为徐州都督，谥号“壮”，画像入凌烟阁，位列二十四功臣之一，其传奇人生至今为世人传颂。