学校现有三亚、五指山两个校区，总占地面积2100余亩，校舍建筑面积60余万平方米，教学科研仪器设备总值3.5亿元。三亚校区位于三亚市吉阳区，毗邻南海，拥有海洋生物实验室、深海技术实验室等特色教学设施；五指山校区地处五指山市，保留民族教育传统，形成“一校两区、山海呼应”的办学格局。
学科建设以海洋学科为核心，涵盖理、工、农、文、管、法、教、艺等8大学科门类，开设53个本科专业。其中，海洋科学、海洋工程与技术、旅游管理、民族学等专业为省级重点学科，海洋科学、食品科学与工程、环境科学与工程等6个专业入选国家级一流本科专业建设点，12个专业入选省级一流本科专业建设点。学校拥有“热带海洋生物资源利用与保护”“南海文化研究”等省级重点实验室和研究中心，构建了特色鲜明的学科体系。师资队伍结构合理，现有教职工1200余人，其中教授、副教授400余人，博士学位教师占比达45%，享受国务院特殊津贴专家、省优专家、省级教学名师等省级以上人才80余人。近年来，教师团队承担国家级科研项目50余项、省部级项目300余项，在热带海洋生态保护、南海文化研究、深海资源勘探等领域取得多项成果，多篇论文发表于《Nature》子刊等国际权威期刊。
学校重实践教学与产教融合，与中国海洋大学、自然资源部第二海洋研究所等单位建立合作，共建“南海海洋资源利用协同创新中心”；与三亚崖州湾科技城、陵水黎安国际教育创新试验区等产业园区联动，培养了大批适应热带海洋经济发展的应用型人才，毕业生就业率连续多年保持在90%以上，为海南自贸港建设提供了重要人才支撑。
校园文化突出民族与海洋特色，设有黎族苗族文化博物馆、海洋文化馆，每年举办“南海文化节”“民族传统体育运动会”等活动，形成“海纳百川、自强不息”的校训精神。作为海南唯一以热带海洋为特色的本科院校，学校正以服务国家海洋强国战略和海南自贸港建设为己任，朝着建成特色鲜明的高水平热带海洋大学目标迈进。