随着第一季的结，不少观众意犹未尽，纷纷追问：“《拜托了老师》第二季有多少集？”事实上，《拜托了老师》并没有官方定义的“第二季”。该动画由童梦Studio DEEN制作，最初便以13集的长度成了核心故事线：草薙桂的“停滞”病症、风见瑞穗的外星身份秘密、两人情感的萌芽与波折，以及最终在家人与朋友的支持下确认彼此心意。制作方在第一季后并未推出续作，故事也因此停留在两人确认关系的温馨节点，没有官方延续。
不过，2003年童梦推出了同世界观下的衍生动画《拜托了双子星》，这部作品常被部分观众误称为《拜托了老师》的“第二季”。《拜托了双子星》以新主角神城麻郁为中心，讲述了他与双胞胎姐妹小野寺桦恋、小野寺遥的相遇与情感纠葛，同样融入了科幻设定如“停滞”现象、外星背景。但严格来说，它与《拜托了老师》是独立故事，仅共享世界观，并非直接续篇。《拜托了双子星》共13集，于2003年7月至9月播出，虽角色与《拜托了老师》偶有联动如风见瑞穗短暂登场，但核心剧情与主线关。
综上，《拜托了老师》仅制作了一季13集动画，官方从未推出“第二季”；若提及“第二季”，多半是对衍生作品《拜托了双子星》的误称，后者同样为13集篇幅，却并非原故事的延续。