首先是官方原版集数。由唐人影视制作的该剧，最初的成片及网络平台、DVD发行版本均为35集。这一版本整呈现了故事脉络，从现代白领张晓穿越成满族少女马尔泰·若曦开篇，到她卷入康熙年间九子夺嫡的宫廷纷争，再到最终离世的结局，35集的紧凑地容纳了人物成长、情感纠葛与历史转折的核心内容，细节铺陈较为连贯，没有过多拆分剧情。
其次是湖南卫视的播出版本。由于电视台晚间黄金档的播出时长限制，以及广告插播、时段拆分的现实需求，该剧在湖南卫视上星播出时，被调整剪辑为39集。这一版本在保留主要剧情的基础上，将原版部分段落适当拆分，延长了单集播出时长以适配电视台的编排节奏，因此集数有所增加。对于当时通过卫视首播追剧的观众而言，39集的版本更为熟悉。
此外，部分海外播出或不同平台的非官方剪辑版本，可能因地区播出略有调整，但核心剧情框架与35集官方原版一致，差异较小。比如在一些海外流媒体平台，该剧有时会以单集时长更短但集数接近35集的形式呈现，本质上并未改变故事的核心结构。
尽管集数存在细微差异，但《步步惊心》凭借细腻的情感表达、对历史细节的合理还原，以及刘诗诗、吴奇隆等演员的自然演绎，成为不少观众心中的古装剧标杆。集数的不同，本质上是播出载体与编排需求的体现，并未影响故事的整度与情感共鸣，也正因如此，论观看的是35集原版还是39集卫视版，观众都能感受到这部剧的经典魅力。