北京大兴-广州 这是南航A380的“黄金航线”，连接首都航空枢纽与华南门户。该航线每日执飞1班，航班号CZ3000北京大兴→广州、CZ3099广州→北京大兴，使用三舱布局头等舱+公务舱+经济舱，可搭载506名乘客。作为南北空中大动脉，此航线常年保持高上座率，尤其在节假日期间常加派A380执飞。
北京大兴-上海虹桥 长三角与京津冀间的核心航线之一，每日执飞1班，航班号CZ3999北京大兴→上海虹桥、CZ3998上海虹桥→北京大兴。航线全程约2小时15分钟，A380的宽敞客舱和静音设计提升了短途干线的出行体验，主要服务商务旅客与旅游客流。
广州-上海虹桥 作为南航基地广州的“主场航线”，广州-上海虹桥航线每日执飞1班A380，航班号CZ359广州→上海虹桥、CZ358上海虹桥→广州。航线覆盖早中晚多个时段，满足两地间高频次出行需求，尤其在广交会、上海进博会等大型展会期间，A380的运力优势显著。
季节性航线：广州-成都双流 在旅游旺季如春节、暑假，南航会临时增派A380执飞广州-成都双流航线，航班号CZ3403广州→成都双流、CZ3404成都双流→广州。该航线依托成都的旅游资源与人口基数，短期内提升运力以应对客流高峰，通常每周执飞3-4班。
以上航线构成了国内A380的核心运营网络，均连接一线枢纽城市，以满足高密度、高需求的航空出行。随着航空市场恢复，南航可能根据客流变化调整A380的执飞计划，具体航班信息可通过航空公司官网实时查询。