随着剧情推进，怀玉的身世之谜逐渐揭开，她的明朝宗室身份曝光后引发朝野震动，孝庄太后与保守派大臣强烈反对这段感情，甚至以傅家满门性命相要挟。康熙在江山与爱情间挣扎，而怀玉则因家族立场与个人情感陷入两难。高潮部分，怀玉为救康熙身中剧毒，性命垂危之际，康熙终于下定决心放弃权力斗争，选择与爱人共渡难关。
结局中，康熙以“赐婚”形式突破重重阻力，册封怀玉为“荣亲王福晋”，既给予她尊贵身份，又避开了后宫妃嫔的复杂身份，使两人得以名正言顺地相守。傅家被免除“谋逆”罪名，恢复爵位，怀玉的父亲傅正成为朝廷重臣，家族危机彻底化。此外，蒙古公主成韵的阴谋最终败露，被打入冷宫，其他反派角色也各自得到应有的结局。
最终场景定格在紫禁城的桃花树下，怀玉与康熙并肩而立，两人褪去帝王与公主的身份枷锁，以寻常夫妻的姿态许诺“一生一世一双人”。这场跨越朝代仇恨与宫廷倾轧的爱情，在历经生死考验后终获圆满，成为许多观众心中的经典结局。