琳的死亡发生在第三次忍界大战期间。当时，雾隐村为了破坏木叶，策划了一场阴险的阴谋：他们在琳的体内植入了尾兽“三尾”，并将她设定为“人柱力兵器”。雾隐的计划是让琳活着回到木叶，然后通过特殊手段强制释放三尾，利用尾兽的强大力量摧毁整个村子。
当琳察觉自己被当作武器后，内心陷入了巨大的痛苦。她深知三尾一旦在木叶释放，数辜村民将丧命，而自己珍视的村子也会化为废墟。为了保护木叶，保护她所爱的人，琳做出了一个决绝的选择——牺牲自己。
在被雾隐忍者追击的过程中，带土和卡卡西及时赶来救援。面对卡卡西伸出的雷切，琳没有退缩，反而主动冲向那把闪烁着电光的利刃。她用自己的身体撞向卡卡西的雷切，以自杀的方式终结了雾隐的阴谋，也守护了木叶的安全。
琳的死，成为了压垮带土的最后一根稻草。亲眼目睹挚友在自己面前被“卡卡西杀死”，带土彻底陷入绝望，他认为忍者世界的“虚假和平”只会带来痛苦，从此走上了颠覆忍界的道路。而卡卡西则因“杀死”琳而背负了一生的愧疚，他将琳的死视为自己心中永远的伤疤。 琳的死亡，是《火影忍者》中最令人惋惜的情节之一。她用生命诠释了忍者的“火之意志”，以自我牺牲的方式守护了村子，这份纯粹的善良与决绝，至今仍被观众铭记。