上部39集的剧情主要围绕小夭的身份之谜展开，从她以“玟小六”的身份在清水镇行医开始，逐步揭开她与涂山璟、相柳、玱玹之间的情感纠葛。这部分剧集通过细腻的人物刻画和铺陈的情节线索，搭建起宏大的世界观，为后续的冲突爆发埋下伏笔。观众可以在39集的中，整看到小夭从隐姓埋名到身份回归的转变过程。
下部21集则聚焦于小夭在情感抉择与家国责任间的挣扎。随着故事进入高潮阶段，剧情节奏明显加快，朝堂权谋与情感矛盾交织推进。21集的内容集中展现了小夭与三位男主的关系走向，以及她在命运洪流中的成长与蜕变。相比上部的铺垫，下部更重矛盾的集中爆发与人物弧光的整呈现。
这种上下部的集数分配，既满足了原著粉丝对细节的期待，也兼顾了普通观众的观剧节奏。39集的上部为故事筑基，21集的下部为情感收束，两者共同构成了整的“长相思”故事宇宙。观众在追剧过程中，可通过上下部集数的区分，更清晰地把握剧情脉络与人物关系发展。