首先是结构上的差异。“What colour is it？”采用“疑问词组What colour+ be动词 + 主语it”的紧凑结构，疑问词组直接指向颜色属性，主语“it”明确指代眼前或对话中已知的具体事物；而“What is the colour？”则是“疑问词What+ be动词 + 名词短语the colour”的整句式，其中“the colour”是特指名词，需依托前文语境才能明确其指代对象——比如前文提到的某件物品、某个设计元素等。
其次是语境适用的不同。“What colour is it？”是日常口语中最自然的表达，多用于直接指向具体事物提问的场景：比如指着桌上的苹果问朋友，或拿起新购买的笔问店员；“What is the colour？”则更偏向正式或需要明确特定对象的场景，例如设计师与客户沟通时说：“The packaging’s accent needs to align with the brand—what is the colour？”此时“the colour”指代品牌规定的 accent 颜色，需前文铺垫才能理。
最后是侧重的区别。“What colour is it？”的核心是聚焦“it”具体事物，重点是询问“这个东西的颜色是什么”，回答多直接指向事物的颜色描述，如“It’s red”；“What is the colour？”的核心是聚焦“the colour”颜色本身，重点是确认“特定对象的颜色具体是什么”，回答可能更颜色的精准性，如“It’s the brand’s standard navy blue”。
简言之，这两个问句并非同义表达，而是因结构、语境与点的不同，适用于不同的交流场景。掌握其差异，能让英语表达更精准自然。