结局的核心落在人与非人伙伴的共存上。狐妖胡离、水鬼青衣、猫妖夜瞳等角色并未离开，而是以更温和的方式融入宝珠的生活——他们不再是需要决的“事件”，而是成为日常中可信赖的存在。例如，胡离仍会在宝珠遇到棘手的灵异麻烦时现身相助，青衣则偶尔在雨夜来访，分享水底的见闻，这种互动消了人与鬼的对立感，转而构建出一种超越生死的情谊。
书中对“未之谜”的处理也强化了结局的未结感。宝珠的身世谜团、她与某些古老精怪的宿命关联，并未得到彻底答。作者用“月光下的约定”暗示这种羁绊将延续：宝珠站在古董店的窗前，看着朋友们的身影消失在夜色中，手中的热茶氤氲着热气，仿佛下一个故事随时会在门铃响起时开启。这种处理让结局更像时间的暂停而非终点，留给读者限想象空间。
最终，《宝珠鬼话》的结局传递出界限消融后的平衡——鬼怪不再是恐怖的符号，人间也并非绝对的“现实”，两者在宝珠的世界里达成了微妙的共生。她既没有成为全职的阴阳师，也没有放弃与非人的联结，而是在普通生活中守护着这份特殊的“日常”，恰如书中最后一句：“灯笼还亮着，故事就不会。”