该行定位为服务农业生产与农村经济的专业金融载体，初期资本由政府拨款与民间资本认购结合，总行设于上海，随后逐步在江苏、浙江、安徽等农业主产区铺设分支机构，服务网络延伸至县域层面，成为当时少数深入农村腹地的金融机构。
在核心业务上，农业贷款发放是其核心举措。该行针对农户、农业合作社推出低息贷款，覆盖粮食种植、畜牧养殖、农田水利建设等场景，打破了以往农村信贷被高利贷垄断的局面。同时，参与农产运销体系构建，通过设立农产品运销分部，帮助农户对接城市市场，减少环节的利益盘剥，提升农产品流通效率。此外，该行还联合农业技术部门，向农户推广新式农具与科学种植技术，间接推动农业生产效率提升。
尽管受时代条件制约，中国农工银行的服务范围与资金规模仍有局限，但它填补了近代中国农业金融的部分空白，为农户提供了相对稳定的资金支持，在缓农村资金短缺、稳定农产品生产方面起到了积极作用，成为近代中国农业金融探索的重要案例。