此版本为日本原版首次正式出版，由横滨美术馆联合独立出版社限量发行。全书采用日本传统和纸印刷，保留手稿原始质感，收录奈良美智2000-2008年间在横滨工作室创作的120幅素描、手稿及随笔，其中包括未公开的女孩形象草稿、装置艺术草图及创作笔记。开本设计遵循艺术家手稿原始尺寸，每页留白与线条密度均经过严格校订，整呈现创作时的空间语境。
作为签名初版，其收藏价值尤为突出。初版仅发行800册，其中200册带有奈良美智亲笔签名及编号，本版本为第137号。签名以黑色马克笔书于扉页右下角，笔触流畅随性，旁侧伴有艺术家标志性的迷你笑脸符号，与手稿中孩童形象的戏谑感形成呼应。相较于后期再版，初版在色彩还原度与纸张耐久性上更为考究，特别是手稿中铅笔淡痕与水彩晕染效果的呈现，具有不可复制的文献价值。
书中内容展现了奈良美智创作中鲜为人知的一面：从横滨港的船只轮廓获得灵感的"航海女孩"系列草稿，到对城市街景的速写式记录，手稿中反复出现的"孤独与反抗"主题，揭示了艺术家对现代社会个体生存状态的持续思考。文字部分以日文手写体呈现，夹杂英文单词与符号涂鸦，体现跨文化语境下的创作张力。
该版本自2009年发行以来，市场流通量持续减少，2023年苏富比亚洲当代艺术拍卖中，同编号区间的签名初版以远超估价3倍的价格成交。其价值不仅在于奈良美智的艺术影响力，更在于手稿载体所具有的创作现场性——每一道修改痕迹、咖啡渍与折痕，都成为连接艺术家与观者的情感媒介。
作为横跨艺术史研究与收藏投资的双重标的，《横滨手稿》2009日版签名初版既见证了奈良美智创作成熟期的思维轨迹，也成为当代艺术市场中衡量稀缺性与文化价值的典型样本。