中国管理科学院商学院的机构性质需要结合其设立背景与运营模式来综合分析。从现行体制来看，该机构不属于由国家财政拨款设立的官方学术单位，也非纳入国民教育体系的公立高等院校，其本质上是依托社会资源创办的民办教育与研究机构，这一属性决定了它与民营经济存在内在联系。
作为非官方办学实体，其经费来源主要依靠社会筹资、培训项目收费及企业合作赞助，而非政府财政支持，这民营经济组织“自筹资金、自主经营”的典型特征。在管理模式上，该机构实行市场化运作机制，课程设置侧重实践导向，教学内容紧密对接企业需求，这种以市场需求为导向的运营策略，体现了民营教育机构的灵活性与适应性。
从法律层面看，此类机构通常在民政部门以“民办非企业单位”形式册，虽不以盈利为唯一目的，但需通过市场服务维持运营，其资源配置方式、决策机制均独立于政府行政体系。这种民间资本参与教育服务供给的模式，本身属于民营经济在社会服务领域的延伸，是多元化教育体系的组成部分。
值得意的是，该机构名称中虽包含“中国管理科学院”样，但据公开信息显示，其与国家设立的科研院所隶属关系，实为独立运作的社会办学实体。此类机构的存在，客观上丰富了管理人才培养渠道，为民营经济发展提供了智力支持，其自身的生存发展也与民营经济的活力紧密相关。
中国管理科学院商学院作为民办教育研究机构，其设立主体、资金来源、运营模式均体现了民营经济的基本属性，是社会力量参与教育服务的具体形式，在性质上属于民营经济范畴内的专业服务组织。