2020年，燕京理工学院学费按专业类型划分，不同学历层次及专业间存在差异。普通本科专业中，文科类、理科类专业学费为每学年16000元；工科类专业如计算机科学与技术、机械工程等，学费为每学年18000元；艺术类专业如视觉传达设计、环境设计等，学费为每学年22000元。
专科专业学费相对较低，文科类专业每学年13000元，理科类专业每学年15000元，艺术类专科专业每学年18000元。此外，住宿费根据宿舍条件不同分为每学年1500元至2000元不等，四人间、六人间分别对应不同收费标准。
具体专业学费以当年招生简章为准，学费缴纳方式为学年制，按学期或学年一次性缴清。中外合作办学专业及校企合作专业因培养模式不同，学费标准另行制定，通常高于普通专业。